工程造价鉴定是指由专业机构对工程项目的造价进行鉴定，以确定工程项目的实际造价。层高不足是指建筑物的实际层高低于设计层高。工程量扣减是指在工程造价鉴定过程中，由于实际工程量与设计工程量不符，需要对工程造价进行相应的扣减。
根据《建筑工程施工质量验收统一标准》（GB 50300-2013）的规定，建筑工程的层高应符合设计要求。如果实际层高低于设计层高，那么是否可以扣减工程量，我们需要从以下几个方面进行分析：
一、合同约定
1. 实际层高低于设计层高时，由建设单位承担相应的损失。
2. 实际层高低于设计层高时，按实际工程量计算工程款。
3. 实际层高低于设计层高时，由施工单位承担相应的损失。
如果合同中没有明确规定，那么我们需要进一步分析以下两个方面。
二、法律规定
根据《国合同法》第一百一十四条规定：“当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。”如果施工单位未按照设计要求施工，导致层高不足，那么施工单位应当承担相应的违约责任。
根据《国建筑法》第四十规定：“建设单位应当严格按照工程设计要求进行施工，不得擅自变更工程设计。”如果施工单位擅自变更工程设计，导致层高不足，那么施工单位也应当承担相应的责任。
三、行业标准
1. 《建筑工程施工质量验收统一标准》（GB 50300-2013）
2. 《建筑工程施工质量验收规范》（GB 50203-2011）
3. 《建筑工程施工质量验收标准》（GB 50204-2015）
根据这些标准，如果实际层高低于设计层高，那么可以按照以下方式扣减工程量：
1. 直接按照实际层高与设计层高的差值，扣减相应的工程量。
2. 按照实际层高与设计层高的差值，乘以相应的单价，扣减相应的工程款。
1. 如果合同中有明确规定，那么按照合同约定执行。
2. 如果合同中没有明确规定，但施工单位未按照设计要求施工，导致层高不足，那么可以按照法律规定扣减工程量。
3. 如果合同中没有明确规定，且施工单位未违反法律规定，那么可以参考行业标准扣减工程量。
在工程造价鉴定过程中，层高不足的扣减是一个复杂的问题，需要综合考虑多种因素。在实际操作中，各方应本着公平、公正的原则，依法依规处理。