当然需要扣除暂列金额。工程预付款起扣点是指在工程结算时，按照合同约定，从预付款中扣除一定比例的款项，以确保工程质量和进度。暂列金额则是指在工程预算中预留的一定金额，用于应对可能出现的意外情况或额外支出。
举个例子，假设某工程项目合同金额为1000万元，合同约定预付款比例为10%，暂列金额为100万元。那么，预付款金额为100万元，暂列金额为100万元。
在工程结算时，我们需要按照合同约定计算起扣点。假设合同约定起扣点为工程结算金额的5%，那么起扣点金额为1000万元×5% = 50万元。
接下来，我们进行实例计算过程：
1. 计算起扣点金额：1000万元×5% = 50万元。
2. 计算扣除暂列金额后的预付款：100万元 – 100万元 = 0万元。
3. 计算实际起扣点金额：50万元 – 0万元 = 50万元。
4. 计算起扣后剩余预付款：100万元 – 50万元 = 50万元。
5. 计算起扣后实际支付金额：1000万元 – 50万元 = 950万元。
在这个例子中，工程预付款起扣点需要扣除暂列金额。扣除暂列金额后，实际起扣点金额为50万元，起扣后剩余预付款为50万元，实际支付金额为950万元。这样，既可以确保工程质量和进度，又能应对可能出现的意外情况或额外支出。