铁路工程总承包三级资质办理的五个关键步骤如下：
一、了解资质要求
1. 了解铁路工程总承包三级资质的具体要求。根据《建筑业企业资质管理规定》，铁路工程总承包三级资质的企业需具备以下条件：
（3）企业具有与承接业务相适应的施工机械和质量检测设备；
（4）企业具有健全的机构、管理制度和财务制度；
（5）企业近三年内无重大安全、质量等不良记录。
2. 了解相关法律法规和，确保办理资质过程中遵守规定。
二、准备申请材料
1. 根据资质要求，准备以下申请材料：
（1）企业法人营业执照副本；
（2）企业章程；
（3）企业法定代表人身份证明；
（4）企业注册资本证明；
（5）企业专业技术人员的资格、职称；
（6）企业施工机械和质量检测设备的证明材料；
（7）企业机构代码证；
（8）企业近三年内无重大安全、质量等不良记录的证明材料；
（9）其他相关证明材料。
2. 确保申请材料齐全、真实、有效，符合资质要求。
三、提交申请
1. 将准备好的申请材料提交至当地建设行政主管部门。
2. 建设行政主管部门对申请材料进行审核，符合要求后，出具《建筑业企业资质申请受理通知书》。
四、领取资质
1. 建设行政主管部门在审核通过后，将资质发放给企业。
2. 企业领取资质后，应妥善保管，不得遗失、损毁。
五、后续管理
1. 企业取得铁路工程总承包三级资质后，应严格遵守法律法规和行业规范，确保工程质量、安全。
2. 定期对资质进行年检，确保资质的有效性。
3. 如企业资质条件发生变化，应及时向建设行政主管部门申请资质变更。
4. 企业在办理资质过程中，如遇到问题，可向建设行政主管部门咨询或寻求专业机构帮助。
通过以上五个关键步骤，新手也能顺利办理铁路工程总承包三级资质。在办理过程中，务必认真对待每一个环节，确保资质办理的顺利进行。