上饶市公共资源交易中心投标保证金计算方式如下：
一、保证金金额
投标保证金金额按照招标文件规定的比例计算，具体比例由招标人根据项目特点、风险程度等因素确定。一般情况下，投标保证金金额不超过招标项目估算价的2%。
二、计算公式
投标保证金金额=招标项目估算价×投标保证金比例
三、投标保证金比例
1. 一般项目：投标保证金比例为2%。
2. 高风险项目：投标保证金比例可根据招标文件要求适当提高，但最高不超过招标项目估算价的5%。
3. 特殊项目：根据招标文件要求，投标保证金比例可适当调整。
四、保证金缴纳方式
1. 现金缴纳：投标人可将投标保证金以现金形式直接缴纳至招标代理机构指定的账户。
2. 银行保函：投标人可向招标代理机构指定的银行申请开具投标保证金银行保函。
3. 信用保证：部分招标项目允许投标人使用信用保证方式缴纳投标保证金，具体要求详见招标文件。
五、保证金退还
1. 退还条件：投标人在投标截止时间前未提交投标文件或未按要求缴纳投标保证金，招标人有权没收其投标保证金。
2. 退还时间：招标人确定中标人后，在签订合同前，应及时退还投标保证金。
3. 退还方式：招标人可选择以下方式退还投标保证金：
（1）银行转账：将投标保证金退还至投标人的银行账户。
（2）现金退还：在招标人指定的地点，由投标人自行领取现金退还。
六、其他注意事项
1. 投标人应严格按照招标文件要求缴纳投标保证金，逾期缴纳或未缴纳投标保证金，其投标文件将被视为无效。
2. 投标保证金缴纳后，如因投标人原因导致其投标文件被废标，招标人有权没收其投标保证金。
3. 投标人应确保缴纳的投标保证金真实、合法，不得以虚假、的银行保函、信用保证等手段缴纳投标保证金。
4. 招标人有权对投标保证金进行，如发现投标保证金存在问题，招标人有权要求投标人补足或更换。
5. 投标人应关注招标文件中关于投标保证金的相关规定，确保按照要求缴纳投标保证金。
上饶市公共资源交易中心投标保证金计算方式较为简单，投标人需严格按照招标文件要求缴纳投标保证金，以确保其投标文件的有效性。投标人还需关注招标文件中的其他相关规定，确保自身权益。