水土保持工程措施与主体工程重复问题，在工程建设中较为常见。针对这一问题，以下将介绍处理原则和案例。
一、处理原则
1. 遵循生态优先原则：在处理水土保持工程措施与主体工程重复问题时，应优先考虑生态保护，确保工程建设对生态环境的影响降至最低。
2. 综合考虑原则：在处理问题时，应综合考虑工程效益、经济效益、社会效益和生态环境效益，力求实现多方面的平衡。
3. 适时调整原则：在工程建设过程中，如发现水土保持工程措施与主体工程重复，应及时调整，确保工程建设的顺利进行。
4. 依法依规原则：在处理问题时，应严格按照相关法律法规和标准进行，确保工程建设的合法合规。
二、案例
1. 案例背景
某地区拟建设一条高速公路，全长100公里。在项目前期阶段，发现高速公路沿线存在水土流失问题，需采取水土保持工程措施。在工程设计和施工过程中，发现水土保持工程措施与高速公路主体工程存在重复现象。
2. 处理措施
（1）调整设计方案：针对水土保持工程措施与主体工程重复的问题，设计单位对高速公路主体工程进行了调整，将部分路基、桥梁等工程与水土保持工程相结合，实现资源共享。
（2）优化施工方案：在施工过程中，施工单位根据调整后的设计方案，优化施工方案，确保水土保持工程与主体工程同步推进。
（3）加强监管：项目监管部门对水土保持工程与主体工程的施工过程进行全程监管，确保各项措施落实到位。
3. 案例效果
通过以上措施，该项目在确保高速公路建设顺利进行的有效解决了水土保持工程措施与主体工程重复的问题。具体效果如下：
（1）节约了工程建设成本，提高了工程效益。
（2）减少了水土流失，保护了生态环境。
（3）为类似项目提供了有益借鉴。
水土保持工程措施与主体工程重复问题是工程建设中常见的问题。在处理此类问题时，应遵循生态优先、综合考虑、适时调整和依法依规等原则。通过调整设计方案、优化施工方案和加强监管等措施，可以有效解决这一问题，实现工程建设与生态环境保护的和谐发展。